{"id":85,"date":"2013-12-06T12:23:58","date_gmt":"2013-12-06T12:23:58","guid":{"rendered":"https:\/\/sites.ifi.unicamp.br\/modelo\/?page_id=26"},"modified":"2014-04-24T18:05:12","modified_gmt":"2014-04-24T18:05:12","slug":"pesquisa","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.ifi.unicamp.br\/mabernal\/pesquisa\/","title":{"rendered":"Pesquisa"},"content":{"rendered":"

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2013-atualidade. <\/b><\/div>\n
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Ainda o processo de quebra do DNA devido ao impacto de uma part\u00edcula carregada energ\u00e9tica n\u00e3o \u00e9 bem conhecido. Por esta raz\u00e3o come\u00e7amos a estudar o processo de intera\u00e7\u00e3o de part\u00edculas carregadas, por enquanto pr\u00f3tons e part\u00edculas alfas, usando t\u00e9cnicas de din\u00e2mica molecular qu\u00e2ntica, em particular a Teoria da Funcional de Densidade Dependente do Tempo (TD-DFT). Desta forma, visamos entender como evolui o DNA depois de ser atingido por uma part\u00edcula carregada.<\/div>\n
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Se n\u00e3o conseguir ver esta anima\u00e7\u00e3o, clique aqui: Surface001<\/a><\/div>\n
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https:\/\/sites.ifi.unicamp.br\/mabernal\/files\/2014\/04\/Surface001.mp4<\/a><\/video><\/div><\/div>\n
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Proton-DNA interaction. The blue surface represents a given electronic density isosurface. The electron capture process can be observed.<\/dd>\n<\/dl>\n<\/div>\n
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2012 – Atual<\/b><\/div>\n<\/div>\n
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Desenvolvimento de um sistema computacional para a simula\u00e7\u00e3o da intera\u00e7\u00e3o da radia\u00e7\u00e3o ionizante com o material gen\u00e9tico humano.<\/div>\n<\/div>\n
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\"Modelo<\/a>

Modelo do B-DNA com resolu\u00e7\u00e3o at\u00f4mica.<\/p><\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n

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Descri\u00e7\u00e3o: A intera\u00e7\u00e3o das radia\u00e7\u00f5es ionizantes com os seres vivos produz dano no DNA. Este dano est\u00e1 relacionado com o surgimento do c\u00e2ncer, assim como com seu tratamento mediante a Radioterapia. O ramo da ci\u00eancia que estuda os efeitos biol\u00f3gicos provocados pelas radia\u00e7\u00f5es ionizantes \u00e9 chamado Radiobiologia. H\u00e1 dois m\u00e9todos principais usados nestes estudos, o experimental e o computacional. O primeiro destes est\u00e1 baseado em estudos in vitro com c\u00e9lulas expostas \u00e0 radia\u00e7\u00e3o e o segundo, no desenvolvimento de modelos biof\u00edsicos em conjunto com c\u00f3digos para simular o transporte de radia\u00e7\u00e3o pelo m\u00e9todo Monte Carlo. O m\u00e9todo experimental tem limita\u00e7\u00f5es para reproduzir variadas condi\u00e7\u00f5es de irradia\u00e7\u00e3o, configura\u00e7\u00f5es do DNA, entre outros par\u00e2metros. As simula\u00e7\u00f5es biof\u00edsicas permitem fazer estudos variando muitos par\u00e2metros e discriminar por fatores que s\u00e3o praticamente imposs\u00edveis de discriminar em estudos in vitro. Ambos os m\u00e9todos s\u00e3o complementares. O projeto europeu GEANT4-DNA est\u00e1 trabalhando no desenvolvimento de um pacote para simular o transporte de \u00edons e el\u00e9trons at\u00e9 energias muito baixas (el\u00e9trons at\u00e9 0.025 eV) para ser usado na \u00e1rea da Nanodosimetria em Radiobiologia. N\u00f3s estamos inseridos nesse projeto como colaboradores. O nosso papel \u00e9 desenvolver modelos biof\u00edsicos para validar o sistema GEANT4-DNA.Temos como objetivo desenvolver um modelo geom\u00e9trico do material gen\u00e9tico humano, tendo em conta os seis n\u00edveis de organiza\u00e7\u00e3o deste e das tr\u00eas principais configura\u00e7\u00f5es do DNA (A, B e Z). Um modelo biof\u00edsico atualizado ser\u00e1 criado para simular o processo do gera\u00e7\u00e3o do dano no DNA depois do impacto de uma part\u00edcula ionizante (dano direto) o de uma esp\u00e9cie qu\u00edmica produzida pela radi\u00f3lise da \u00e1gua (dano indireto). Ao final, espera-se ter uma ferramenta computacional para predizer a efetividade biol\u00f3gica de feixes de f\u00f3tons, el\u00e9trons e \u00edons leves, usados na Radioterapia ou no Radiodiagn\u00f3stico.. Situa\u00e7\u00e3o: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Gradua\u00e7\u00e3o: (2) . Integrantes: Mario Antonio Bernal Rodriguez – Coordenador. Financiador(es): Funda\u00e7\u00e3o de Amparo \u00e0 Pesquisa do Estado de S\u00e3o Paulo – Aux\u00edlio financeiro.<\/div>\n<\/div>\n

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2009 – 2011<\/b><\/div>\n<\/div>\n
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Nanodosimetria na radiobiologia de feixes de \u00edons r\u00e1pidos empregados em radioterapia de c\u00e2ncer<\/div>\n<\/div>\n
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Descri\u00e7\u00e3o: Uso do m\u00e9todo Monte Carlo para simular detalhadamente o transporte de \u00edons e el\u00e9trons em \u00e1gua l\u00edquida. Fazer simula\u00e7\u00f5es para determinar as probabilidades de danos ao DNA feitos pelas radia\u00e7\u00f5es.. Situa\u00e7\u00e3o: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acad\u00eamico: (1) . Integrantes: Mario Antonio Bernal Rodriguez – Integrante \/ Carlos Eduardo de Almeida – Coordenador \/ Evangelina Souza – Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient\u00edfico e Tecnol\u00f3gico – Aux\u00edlio financeiro. N\u00famero de produ\u00e7\u00f5es C, T & A: 5<\/div>\n<\/div>\n

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2000 – 2001<\/b><\/div>\n<\/div>\n
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Validation of the Treatment Planning System PLANEX<\/div>\n<\/div>\n
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Descri\u00e7\u00e3o: Valida\u00e7\u00e3o do sistema computadorizado em 2D para o planejamento de tratamentos de teleterapia.. Situa\u00e7\u00e3o: Conclu\u00eddo; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mario Antonio Bernal Rodriguez – Coordenador. Financiador(es): Agencia Internacional de Energ\u00eda At\u00f3mica – Aux\u00edlio financeiro.<\/div>\n<\/div>\n

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1996 – 2000<\/b><\/div>\n<\/div>\n
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Dose determination with plane- parallel ionization chambers in therapeutic electron and photon beams.<\/div>\n<\/div>\n
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Descri\u00e7\u00e3o: Projeto para avaliar o uso de c\u00e2maras de ioniza\u00e7\u00e3o plano-paralelas em feixes de el\u00e9trons de alta energia, usados no tratamento do c\u00e2ncer.. Situa\u00e7\u00e3o: Conclu\u00eddo; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mario Antonio Bernal Rodriguez – Integrante \/ Jos\u00e9 Luis Alonso – Integrante \/ Rodolfo Alfonso – Integrante \/ Ileana SIlvestre – Integrante \/ Adri\u00e1n P\u00e9rez – Integrante \/ Jorge Morales – Integrante. Financiador(es): Organismo Internacional de Energia At\u00c3\u00b4mica – Coopera\u00e7\u00e3o.<\/div>\n<\/div>\n

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2013-atualidade. Ainda o processo de quebra do DNA devido ao impacto de uma part\u00edcula carregada energ\u00e9tica n\u00e3o \u00e9 bem conhecido. Por esta raz\u00e3o come\u00e7amos a estudar o processo de intera\u00e7\u00e3o de part\u00edculas carregadas, por enquanto pr\u00f3tons e part\u00edculas alfas, usando t\u00e9cnicas de din\u00e2mica molecular qu\u00e2ntica, em particular a Teoria da Funcional de Densidade Dependente do … <\/p>\n

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