O Instituto Nacional em Ciência e Tecnologia – Materiais Quânticos Avançados (INCT-MQA) está sediado na Universidade Estadual de Campinas – UNICAMP e conta com os seguintes Laboratórios Associados:
- Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas – CBPF, RJ
- Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais – CNPEM, SP
- Escola de Engenharia de Lorena – EEL/USP, SP
- Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro – PUC-Rio, RJ
- Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ, RJ
- Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho – UNESP, SP
- Universidade Federal do ABC – UFABC, SP
- Universidade Federal do Amazonas – UFAM, AM
- Universidade Federal do Ceará – UFC, CE
- Universidade Federal do Espírito Santo – UFES, ES
- Universidade Federal Fluminense – UFF, RJ
- Universidade Federal de Goiás – UFG, GO
- Universidade Federal do Maranhão – UFMA, MA
- Universidade Federal de Mato Grosso do Sul – UFMS, MS
- Universidade Federal de Minas Gerais – UFMG, MG
- Universidade Federal do Paraná – UFPR, PR
- Universidade Federal de Pelotas – UFPEL, RS
- Universidade Federal de Pernambuco – UFPE, PE
- Universidade Federal do Recôncavo da Bahia – UFRB, BA
- Universidade Federal do Rio Grande – FURG, RS
- Universidade Federal do Rio Grande do Norte – UFRN, RN
- Universidade Federal do Rio Grande do Sul – UFRGS, RS
- Universidade Federal do Rio de Janeiro – UFRJ, RJ
- Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro – UFRRJ, RJ
- Universidade Federal de São Carlos – UFSCAR, SP
- Universidade Federal de São João Del Rei – UFSJ, MG
- Universidade Federal de Sergipe – UFS, SE
- Universidade Federal de Uberlândia – UFU, MG
- Universidade Federal de Viçosa – UFV, MG
- Universidade de São Paulo – USP, SP
- Universidade Tecnológica Federal do Paraná – UTFPR, PR
Além dos Laboratórios Associados, dezenas de instituições estrangeiras participam como colaboradoras deste grande projeto de Ciência e Tecnologia.