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Visualização e desenvolvimento

O computador mach que todos os usuários da Planck também tem acesso e que faz parte do cluster planck foi projetado para ser uma estação de visualização de dados científicos e para desenvolvimento em GPU e CPU, para isso possui:

  1. Intel Xeon E5-2609 de 4 núcleos a 2.4 GHZ;
  2. 16GB de RAM;
  3. Interconexão Infiniband 40 Gb/s;
  4. Dados compartilhados com o cluster Planck;
  5. Quadro K600 com 1GB de memória de vídeo e 192 CUDA cores.

A máquina possui diversos softwares para a visualização de dados científicos. Os programas instalados para visualização estão na Tabela 1.

Tabela 1:
Software para visualização.
Nome Site Comando
Ovito – The Open Visualization Tool http://www.ovito.org/ ovito
Vesta – Visualization for Eletronic and Structural Analysis http://jp-minerals.org/vesta/en/ vesta
VisIt https://wci.llnl.gov/codes/visit/ visit
VMD – Visual Molecular Dynamics http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ vmd
OpenDx www.opendx.org/ dxvgl
Molden http://www.cmbi.ru.nl/molden/ molden
Xcrysden http://www.cmbi.ru.nl/molden/ xcrysdenvgl
Xfarbe https://www.gnz.mpg.de/gnz/pub/xfarbe_doc.html xfarbe

Para ter acesso a esses programas é necessário instalar um pequeno cliente do VirtualGL. O VirtualGL é um software que permite disponibilizar através da rede a aceleração gráfica da GPU (http://sourceforge.net/projects/virtualgl/files/2.3.3/), deve-se escolher o pacote correto para cada sistema operacional.

Após a instalação é necessário conectar via terminal na mach da seguinte forma: vglconnect usuário@mach e após executar os comandos citados na Tabela 1.

Foram feitos testes com sucesso no GNU/Linux, MS Windows e MacOS utilizando o VirtualGl. Caso necessário rodar algum outro software com aceleração 3D é necessário executa-lo juntamente com o comando vglrun (ex: vglrun glxgears).